More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0981 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0981  sensor histidine kinase  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3308  ATPase domain-containing protein  80.68 
 
 		 409 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  80.19 
 
 		 409 aa  354  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000601412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3205  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  79.71 
 
 		 409 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.67 
 
 		 412 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0631  signal transduction histidine kinase-like protein  44.12 
 
 		 398 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.391639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 536 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 546 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  32.54 
 
 		 452 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  33.01 
 
 		 538 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 535 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 464 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 535 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 523 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 535 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 536 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 535 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  31.22 
 
 		 428 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3689  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 430 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142231  normal  0.016382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3500  histidine kinase  31.68 
 
 		 430 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 432 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  31.22 
 
 		 428 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  33.66 
 
 		 485 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 430 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 433 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 550 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  32.02 
 
 		 429 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 431 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3061  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 436 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0291  helix-turn-helix, AraC type  30.46 
 
 		 424 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457062  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  32.51 
 
 		 561 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  29 
 
 		 431 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2801  sensor protein RstB, putative  33.68 
 
 		 420 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 428 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  33.67 
 
 		 439 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 563 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  32.52 
 
 		 561 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1031  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.07 
 
 		 431 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.286161  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2700  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  32.02 
 
 		 412 aa  91.7  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 376 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 450 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  30.41 
 
 		 450 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 450 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 450 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 450 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 429 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 450 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 450 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 447 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1427  sensor protein RstB  28.44 
 
 		 439 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 447 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 447 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 447 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 		 447 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 420 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  30.93 
 
 		 452 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  29.9 
 
 		 450 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  29.72 
 
 		 434 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 376 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.04612  normal  0.0125384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 376 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  29.9 
 
 		 448 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  31.6 
 
 		 347 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 428 aa  89  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 535 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  29.15 
 
 		 438 aa  88.2  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  30.52 
 
 		 431 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 376 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 376 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 376 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.63 
 
 		 433 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  32.68 
 
 		 442 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  32.35 
 
 		 376 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 442 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 442 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0845  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 472 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0033  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 433 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0816  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 401 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 442 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 442 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2192  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 433 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 442 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1782  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 371 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 469 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0938  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 450 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 461 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1590  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 433 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0099  hypothetical protein  30.88 
 
 		 534 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0192732  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  31.02 
 
 		 461 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  29.47 
 
 		 470 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 441 aa  85.1  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 430 aa  85.1  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  28.64 
 
 		 430 aa  84.7  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  32.85 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  30.65 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 760 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  28.64 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  30.65 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  30.65 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  30.65 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  29 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>