More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0963 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0963  aspartate kinase  100 
 
 
400 aa  816    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1483  aspartate kinase  83.17 
 
 
401 aa  678    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1454  aspartate kinase  83.17 
 
 
401 aa  678    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.418783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1412  aspartate kinase  41.65 
 
 
401 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0255759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1274  aspartate kinase  41.15 
 
 
401 aa  332  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0075  aspartate kinase  41.19 
 
 
400 aa  323  4e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1878  aspartate kinase  40.95 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1002  aspartate kinase  42.82 
 
 
400 aa  315  8e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1221  aspartate kinase  41.1 
 
 
399 aa  305  9.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  40.69 
 
 
426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  41 
 
 
427 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  40.5 
 
 
411 aa  301  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2990  aspartate kinase  42.82 
 
 
400 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000125999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  40.85 
 
 
427 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  39.95 
 
 
403 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  40.7 
 
 
401 aa  290  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  40.84 
 
 
407 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  39.39 
 
 
409 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  39.39 
 
 
404 aa  288  8e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  41.29 
 
 
409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  41.04 
 
 
409 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  41.04 
 
 
409 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1857  aspartate kinase  41.04 
 
 
409 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.974180000000001e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  40.55 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  40.8 
 
 
409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  39.13 
 
 
415 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1821  aspartate kinase  39.55 
 
 
409 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.529675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1675  aspartate kinase  39.3 
 
 
409 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  38.46 
 
 
406 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  40.05 
 
 
411 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  40.05 
 
 
409 aa  279  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  40.3 
 
 
409 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3521  aspartate kinase  39.8 
 
 
409 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  41.09 
 
 
422 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  39.14 
 
 
400 aa  276  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  39.2 
 
 
408 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  38.94 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  38.9 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  39.39 
 
 
400 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  37.72 
 
 
408 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  40.7 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  39.35 
 
 
410 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  38.29 
 
 
409 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  39.25 
 
 
404 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  39.9 
 
 
408 aa  272  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  40.25 
 
 
406 aa  272  9e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3519  aspartate kinase  40.1 
 
 
405 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  39.6 
 
 
412 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0808  aspartate kinase  38.06 
 
 
417 aa  271  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  37.28 
 
 
411 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  40.45 
 
 
399 aa  271  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  38.85 
 
 
410 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  38.38 
 
 
400 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  38.9 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  37.59 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1705  aspartate kinase  37.5 
 
 
417 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.794446  normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  38 
 
 
411 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  36.71 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  37.93 
 
 
422 aa  269  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  38.54 
 
 
411 aa  268  8.999999999999999e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  38.85 
 
 
413 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  38 
 
 
411 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  39.65 
 
 
409 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  36.47 
 
 
428 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  37.09 
 
 
405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  37.34 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  37.68 
 
 
419 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  37.75 
 
 
411 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  37.75 
 
 
411 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1965  aspartate kinase  36.25 
 
 
405 aa  266  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0866474  hitchhiker  0.000866025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  39.08 
 
 
424 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  39.1 
 
 
409 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  38.22 
 
 
601 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  36.06 
 
 
417 aa  265  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  38.01 
 
 
427 aa  265  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  39.45 
 
 
408 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  38.85 
 
 
408 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  38.85 
 
 
408 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  38.73 
 
 
422 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  39.9 
 
 
408 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  39.66 
 
 
418 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  36.97 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  37.01 
 
 
424 aa  263  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  37.75 
 
 
410 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  37.75 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  39 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  36.47 
 
 
434 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0110  aspartate kinase  38.24 
 
 
411 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  37.75 
 
 
410 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1001  aspartate kinase  38.5 
 
 
417 aa  261  1e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  37.91 
 
 
405 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  39.12 
 
 
423 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  37.25 
 
 
413 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  37.47 
 
 
423 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  37.75 
 
 
417 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1246  aspartate kinase  38.29 
 
 
588 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0595781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  34.57 
 
 
599 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  37.26 
 
 
599 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  40.05 
 
 
410 aa  259  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6573  aspartate kinase  38.42 
 
 
422 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>