More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1274 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1274  aspartate kinase  100 
 
 
401 aa  812    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164271  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1412  aspartate kinase  98 
 
 
401 aa  798    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0255759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0075  aspartate kinase  64.84 
 
 
400 aa  513  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1878  aspartate kinase  58.96 
 
 
399 aa  486  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1221  aspartate kinase  55.86 
 
 
399 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  49.88 
 
 
427 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  48.76 
 
 
412 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  46.08 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  45.79 
 
 
406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  42.79 
 
 
428 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  42.31 
 
 
428 aa  333  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0963  aspartate kinase  41.15 
 
 
400 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  43.67 
 
 
411 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  44.72 
 
 
411 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  43.92 
 
 
411 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  46.15 
 
 
407 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  46.42 
 
 
409 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  47.38 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1002  aspartate kinase  44.91 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  44.36 
 
 
409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  44.31 
 
 
412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  47.41 
 
 
410 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  43.42 
 
 
411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  43.84 
 
 
410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  43.84 
 
 
410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  43.42 
 
 
411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  45.52 
 
 
411 aa  325  6e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  46.3 
 
 
599 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  43.77 
 
 
423 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  46.42 
 
 
408 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  44.06 
 
 
412 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3600  aspartate kinase  45.97 
 
 
404 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000134751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  44.23 
 
 
424 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  42.93 
 
 
423 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  46.63 
 
 
411 aa  322  5e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  45.45 
 
 
405 aa  322  6e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  46.19 
 
 
407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  45.54 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  49.63 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  43.98 
 
 
408 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  46.19 
 
 
412 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1965  aspartate kinase  45.05 
 
 
405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0866474  hitchhiker  0.000866025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  43.35 
 
 
413 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  43.66 
 
 
424 aa  319  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  43.46 
 
 
413 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  44.47 
 
 
405 aa  319  7e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  46.42 
 
 
409 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  46.81 
 
 
416 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  43.94 
 
 
434 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  43.38 
 
 
410 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  44.47 
 
 
405 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  43.87 
 
 
422 aa  317  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  42.47 
 
 
403 aa  316  4e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1454  aspartate kinase  40.05 
 
 
401 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.418783  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1483  aspartate kinase  40.05 
 
 
401 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  45.68 
 
 
409 aa  315  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  45.93 
 
 
601 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  44.42 
 
 
599 aa  315  8e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  43.6 
 
 
414 aa  315  9e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  44.09 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1001  aspartate kinase  46.28 
 
 
616 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1175  aspartate kinase  46.06 
 
 
599 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  44.28 
 
 
424 aa  314  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  44.09 
 
 
411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  45.1 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  44.58 
 
 
407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  42.82 
 
 
427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  43.14 
 
 
422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  41.87 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  44.25 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  41.98 
 
 
409 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  42.46 
 
 
404 aa  313  4.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0976  aspartate kinase  43.7 
 
 
408 aa  312  6.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2990  aspartate kinase  44.94 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000125999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  45.61 
 
 
421 aa  312  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  42.64 
 
 
400 aa  311  9e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  42.93 
 
 
426 aa  311  9e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3014  aspartate kinase  45.93 
 
 
406 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000193467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  45.3 
 
 
410 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  46.06 
 
 
404 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  43.92 
 
 
400 aa  310  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  42.86 
 
 
413 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  43.41 
 
 
421 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  43.63 
 
 
421 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  43.63 
 
 
421 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  43.63 
 
 
421 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  43.67 
 
 
400 aa  310  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  43.35 
 
 
409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  44.31 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0226  aspartate kinase  43.77 
 
 
421 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  43.42 
 
 
400 aa  308  8e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  44.55 
 
 
409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  44.09 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  45.07 
 
 
416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0265  aspartate kinase  43.77 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.472998  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1711  aspartate kinase  43.95 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  43.2 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  42.79 
 
 
420 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  44.12 
 
 
421 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  43.03 
 
 
421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>