More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1654 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1701  flagellar biosynthetic protein FlhB  87.37 
 
 
380 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000237151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0066  flagellar protein FlhB  87.37 
 
 
380 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1654  flagellar biosynthetic protein FlhB  100 
 
 
380 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.461635  normal  0.455272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.43 
 
 
381 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.34 
 
 
378 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.57 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.68 
 
 
376 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.73 
 
 
376 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.23 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.48 
 
 
386 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.63 
 
 
377 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.91 
 
 
390 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.48 
 
 
386 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.15 
 
 
376 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0214  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.64 
 
 
379 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.772571  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.1 
 
 
384 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 
376 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.6 
 
 
383 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.06 
 
 
383 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.03 
 
 
392 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.02 
 
 
378 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 
382 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.52 
 
 
390 aa  206  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.72 
 
 
383 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.6 
 
 
377 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.47 
 
 
383 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.96 
 
 
381 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.97 
 
 
374 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 
383 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.62 
 
 
376 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.93 
 
 
363 aa  204  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.41 
 
 
377 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.29 
 
 
378 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.87 
 
 
382 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.24 
 
 
378 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.55 
 
 
377 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.01 
 
 
376 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.13 
 
 
376 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.35 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.53 
 
 
403 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.22 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.97 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  38.82 
 
 
402 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.13 
 
 
383 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.13 
 
 
383 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.13 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.22 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.98 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.48 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.2 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.13 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.67 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.13 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.02 
 
 
406 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.14 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.48 
 
 
398 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.83 
 
 
376 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.41 
 
 
376 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.41 
 
 
376 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.11 
 
 
376 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.11 
 
 
376 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.89 
 
 
377 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.62 
 
 
376 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.13 
 
 
376 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.54 
 
 
357 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  34.83 
 
 
369 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.35 
 
 
380 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.84 
 
 
376 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.71 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.37 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.37 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.59 
 
 
379 aa  189  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37481  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 
380 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  34.85 
 
 
374 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.89 
 
 
360 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.44 
 
 
405 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.24 
 
 
380 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.2 
 
 
377 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.55 
 
 
376 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.07 
 
 
376 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.61 
 
 
356 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  38.14 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.14 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.89 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  38.14 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.7 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.43 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.14 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.14 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.14 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.84 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.14 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.84 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.84 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.84 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.84 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.76 
 
 
399 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.76 
 
 
399 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.44 
 
 
405 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>