38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1452 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0193  hypothetical protein  90.65 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.567185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1826  hypothetical protein  90.65 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1269  hypothetical protein  60.42 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1520  hypothetical protein  50.98 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161545  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1392  hypothetical protein  52.38 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0377861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2718  hypothetical protein  54.17 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.225561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2437  cellulase-like protein  41.18 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1263  hypothetical protein  37.14 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11983  hitchhiker  0.000846032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3295  cellulase-like protein  37.1 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0728975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2562  hypothetical protein  31.2 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1034  conserved hypothetical proteinn  34.21 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0900  hypothetical protein  32.97 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0949  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385116  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_004310  BR0904  hypothetical protein  32.97 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1785  hypothetical protein  33.7 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2276  hypothetical protein  32.67 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.286021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0825  hypothetical protein  32.65 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2704  hypothetical protein  35.63 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0700499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1532  hypothetical protein  31.13 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1811  hypothetical protein  35.87 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4221  hypothetical protein  34.78 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1229  hypothetical protein  34.41 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1100  hypothetical protein  34.41 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3026  hypothetical protein  34.78 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3495  hypothetical protein  30.43 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2883  hypothetical protein  35.63 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744665  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1108  hypothetical protein  34.26 
 
 		 307 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0473117  normal  0.112563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1727  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000188947  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1718  cellulase-like protein  30.56 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.842574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1758  hypothetical protein  35.87 
 
 		 397 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.148123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1951  hypothetical protein  31.58 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0297  hypothetical protein  30.83 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445535  decreased coverage  0.00079076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0187  hypothetical protein  32.61 
 
 		 240 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.368887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2422  hypothetical protein  33.7 
 
 		 316 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0248233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6040  hypothetical protein  31.52 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112741  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0556  hypothetical protein  26.26 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000827184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>