38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2704 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2704  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  634    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0700499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3026  hypothetical protein  84.39 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2422  hypothetical protein  80.14 
 
 		 316 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0248233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2883  hypothetical protein  73.72 
 
 		 309 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744665  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4221  hypothetical protein  65.59 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1811  hypothetical protein  72 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1758  hypothetical protein  65.45 
 
 		 397 aa  281  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.148123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3495  hypothetical protein  67.27 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0297  hypothetical protein  57.75 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445535  decreased coverage  0.00079076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0305  hypothetical protein  49.4 
 
 		 218 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6040  hypothetical protein  58.27 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0187  hypothetical protein  65.35 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.368887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1034  conserved hypothetical proteinn  59.02 
 
 		 219 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1229  hypothetical protein  58.82 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1100  hypothetical protein  58.82 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1785  hypothetical protein  59.66 
 
 		 171 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2276  hypothetical protein  56.35 
 
 		 156 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.286021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1532  hypothetical protein  65.35 
 
 		 146 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0900  hypothetical protein  57.14 
 
 		 156 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0904  hypothetical protein  57.14 
 
 		 156 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1727  hypothetical protein  56.45 
 
 		 146 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000188947  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0949  hypothetical protein  62.26 
 
 		 150 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385116  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1718  cellulase-like protein  59.41 
 
 		 141 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.842574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1951  hypothetical protein  54.62 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0556  hypothetical protein  55.45 
 
 		 132 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000827184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3295  cellulase-like protein  48.96 
 
 		 135 aa  96.3  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0728975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1263  hypothetical protein  44.68 
 
 		 158 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11983  hitchhiker  0.000846032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2562  hypothetical protein  38.6 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1269  hypothetical protein  39.78 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2437  cellulase-like protein  32.26 
 
 		 163 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2718  hypothetical protein  34.02 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.225561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0825  hypothetical protein  33.98 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1520  hypothetical protein  36.96 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161545  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1826  hypothetical protein  35.35 
 
 		 123 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0193  hypothetical protein  35.35 
 
 		 123 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.567185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1108  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0473117  normal  0.112563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1392  hypothetical protein  35.65 
 
 		 180 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0377861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1452  hypothetical protein  34.83 
 
 		 123 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>