38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1727 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000188947  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1532  hypothetical protein  95.89 
 
 		 146 aa  265  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2276  hypothetical protein  78.4 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.286021  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1785  hypothetical protein  72.59 
 
 		 171 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0904  hypothetical protein  72.79 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0900  hypothetical protein  72.79 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0949  hypothetical protein  77.39 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385116  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1718  cellulase-like protein  74.77 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.842574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1034  conserved hypothetical proteinn  65.6 
 
 		 219 aa  176  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0297  hypothetical protein  62.22 
 
 		 210 aa  176  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445535  decreased coverage  0.00079076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0305  hypothetical protein  66.4 
 
 		 218 aa  174  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1229  hypothetical protein  73.08 
 
 		 219 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1100  hypothetical protein  73.08 
 
 		 219 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6040  hypothetical protein  69.23 
 
 		 210 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0187  hypothetical protein  61.11 
 
 		 240 aa  153  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.368887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3495  hypothetical protein  64.15 
 
 		 228 aa  151  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1758  hypothetical protein  67.96 
 
 		 397 aa  150  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.148123 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0556  hypothetical protein  60.71 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000827184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1951  hypothetical protein  59.32 
 
 		 247 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2883  hypothetical protein  65.69 
 
 		 309 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744665  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2422  hypothetical protein  64.36 
 
 		 316 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0248233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3026  hypothetical protein  63.55 
 
 		 326 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1811  hypothetical protein  67.33 
 
 		 306 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2704  hypothetical protein  65.35 
 
 		 329 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0700499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4221  hypothetical protein  65.35 
 
 		 316 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3295  cellulase-like protein  48.03 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0728975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1263  hypothetical protein  42 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11983  hitchhiker  0.000846032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2437  cellulase-like protein  33.58 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2562  hypothetical protein  35.14 
 
 		 227 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1269  hypothetical protein  38.71 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161545  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0825  hypothetical protein  44.26 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1392  hypothetical protein  36.78 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0377861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2718  hypothetical protein  34.83 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.225561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1452  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1826  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0193  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.567185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1108  hypothetical protein  26.47 
 
 		 307 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0473117  normal  0.112563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>