34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1108 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0473117  normal  0.112563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0172  hypothetical protein  34.91 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1263  hypothetical protein  32.32 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11983  hitchhiker  0.000846032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4221  hypothetical protein  28.7 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2883  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744665  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2422  hypothetical protein  24.74 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0248233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2562  hypothetical protein  32.35 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3026  hypothetical protein  25.84 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2704  hypothetical protein  26.44 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0700499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1034  conserved hypothetical proteinn  28.18 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1811  hypothetical protein  31.03 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0187  hypothetical protein  28.42 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.368887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0305  hypothetical protein  29.06 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1100  hypothetical protein  28.18 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3295  cellulase-like protein  32.29 
 
 		 135 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0728975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3495  hypothetical protein  26.44 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1229  hypothetical protein  28.18 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1758  hypothetical protein  29.59 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.148123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1826  hypothetical protein  34.44 
 
 		 123 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0193  hypothetical protein  34.44 
 
 		 123 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.567185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0949  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385116  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6040  hypothetical protein  30.53 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1951  hypothetical protein  26.53 
 
 		 247 aa  49.3  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0297  hypothetical protein  29.47 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445535  decreased coverage  0.00079076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1452  hypothetical protein  34.44 
 
 		 123 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.07 
 
 		 2914 aa  48.9  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2276  hypothetical protein  25.51 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.286021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2437  cellulase-like protein  35.23 
 
 		 163 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1520  hypothetical protein  27.59 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161545  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1532  hypothetical protein  26.67 
 
 		 146 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0900  hypothetical protein  25.51 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0904  hypothetical protein  25.51 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1718  cellulase-like protein  26 
 
 		 141 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.842574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>