38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1532 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1532  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  302  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1727  hypothetical protein  95.89 
 
 
146 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000188947  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1785  hypothetical protein  74.62 
 
 
171 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2276  hypothetical protein  77.78 
 
 
156 aa  205  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.286021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0904  hypothetical protein  82.46 
 
 
156 aa  202  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0900  hypothetical protein  82.46 
 
 
156 aa  202  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0949  hypothetical protein  77.39 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385116  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1718  cellulase-like protein  75.68 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.842574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0297  hypothetical protein  62.96 
 
 
210 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445535  decreased coverage  0.00079076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1034  conserved hypothetical proteinn  67.2 
 
 
219 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0305  hypothetical protein  64.84 
 
 
218 aa  173  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1229  hypothetical protein  73.08 
 
 
219 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1100  hypothetical protein  73.08 
 
 
219 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6040  hypothetical protein  69.23 
 
 
210 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0187  hypothetical protein  61.11 
 
 
240 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.368887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3495  hypothetical protein  64.15 
 
 
228 aa  150  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1758  hypothetical protein  67.96 
 
 
397 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.148123 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0556  hypothetical protein  59.48 
 
 
132 aa  149  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000827184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1951  hypothetical protein  59.32 
 
 
247 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368782  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2883  hypothetical protein  65.69 
 
 
309 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744665  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3026  hypothetical protein  63.55 
 
 
326 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2422  hypothetical protein  64.36 
 
 
316 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0248233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1811  hypothetical protein  67.33 
 
 
306 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2704  hypothetical protein  65.35 
 
 
329 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0700499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4221  hypothetical protein  55.38 
 
 
316 aa  146  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3295  cellulase-like protein  48.03 
 
 
135 aa  116  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0728975  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1263  hypothetical protein  42 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11983  hitchhiker  0.000846032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2437  cellulase-like protein  34.06 
 
 
163 aa  77  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2562  hypothetical protein  35.14 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1269  hypothetical protein  39.78 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2718  hypothetical protein  32.03 
 
 
184 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.225561  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1520  hypothetical protein  35 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161545  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0825  hypothetical protein  52.27 
 
 
217 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1392  hypothetical protein  37.93 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0377861  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1452  hypothetical protein  32.29 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32918  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1826  hypothetical protein  32.29 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0193  hypothetical protein  32.29 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.567185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1108  hypothetical protein  26.28 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0473117  normal  0.112563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>