38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1392 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0377861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1452  hypothetical protein  53.4 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0193  hypothetical protein  53.4 
 
 		 123 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.567185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1826  hypothetical protein  53.4 
 
 		 123 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1520  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161545  normal  0.625919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1269  hypothetical protein  49.43 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2718  hypothetical protein  37.08 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.225561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2437  cellulase-like protein  45.36 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3295  cellulase-like protein  39.13 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0728975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1263  hypothetical protein  41.84 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11983  hitchhiker  0.000846032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1034  conserved hypothetical proteinn  36.84 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1100  hypothetical protein  36.84 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1229  hypothetical protein  36.84 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0305  hypothetical protein  36.97 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1951  hypothetical protein  40.57 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2276  hypothetical protein  38.04 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.286021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0900  hypothetical protein  39.08 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0904  hypothetical protein  39.08 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1785  hypothetical protein  38.38 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0949  hypothetical protein  36.96 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385116  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0297  hypothetical protein  37.93 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445535  decreased coverage  0.00079076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6040  hypothetical protein  36.78 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1727  hypothetical protein  35.63 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000188947  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1718  cellulase-like protein  37.93 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.842574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3495  hypothetical protein  30.77 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0825  hypothetical protein  32.38 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1532  hypothetical protein  36.78 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  0.668757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2422  hypothetical protein  38.71 
 
 		 316 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0248233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0187  hypothetical protein  36.78 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.368887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2562  hypothetical protein  30.63 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3026  hypothetical protein  37.63 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2704  hypothetical protein  37.78 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0700499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1758  hypothetical protein  38.89 
 
 		 397 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.148123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4221  hypothetical protein  36.67 
 
 		 316 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2883  hypothetical protein  36.67 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744665  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0556  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  54.3  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000827184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1811  hypothetical protein  37.78 
 
 		 306 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121667  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1108  hypothetical protein  31.11 
 
 		 307 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0473117  normal  0.112563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>