281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3669 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3669  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 364 aa  743    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.962708 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4746  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 364 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  58.69 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4733  glycosyl transferase family 2  54.04 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3656  glycosyl transferase family 2  54.04 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 657 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 646 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 677 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 797 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 798 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 826 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2550  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.930398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 		 1162 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  39.78 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  37.8 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 754 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1477  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 		 877 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 640 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  37.09 
 
 		 427 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 		 1435 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4188  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 644 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0515  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 857 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 		 1268 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 392 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1511  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.675878  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0270  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2617  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000160485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2521  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00644687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0888  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 363 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 		 438 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2810  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  33.17 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1695  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0169  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 860 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0171  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 860 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  57.14 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0981  beta 1,4 glucosyltransferase  57.14 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1812  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 875 aa  79.3  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0991  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1263  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1131  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1224  group 2 family glycosyl transferase  30.56 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0772  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0409043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1111  glycosyltransferase  30.56 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 633 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4078  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1578  glycosyl transferase  29.59 
 
 		 183 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0848772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0933  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0802  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 1523 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  48.81 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0220  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 608 aa  72.8  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 255 aa  72.4  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 249 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0323  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00034223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.33 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.33 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1105  glycosyltransferase  28.33 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 1523 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31300  glycosyl transferase  35.9 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 250 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 250 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 250 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.94 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.94 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  45.74 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.94 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  41.86 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.94 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.94 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.94 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  32.94 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  44.05 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>