51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2433 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2433  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2839  hypothetical protein  93.5 
 
 		 246 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2567  hypothetical protein  82.1 
 
 		 250 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6605  hypothetical protein  78.95 
 
 		 267 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202488  normal  0.0603228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2586  hypothetical protein  74.17 
 
 		 270 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195535  normal  0.261954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2935  hypothetical protein  75.65 
 
 		 247 aa  357  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4874  hypothetical protein  70.74 
 
 		 242 aa  351  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0356  hypothetical protein  71.49 
 
 		 287 aa  351  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5181  hypothetical protein  72.37 
 
 		 247 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4653  hypothetical protein  72.37 
 
 		 263 aa  349  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000611721  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3431  hypothetical protein  73.68 
 
 		 290 aa  348  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0788325  normal  0.331854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3075  hypothetical protein  71.49 
 
 		 253 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5292  hypothetical protein  71.49 
 
 		 253 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4976  hypothetical protein  71.05 
 
 		 253 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4641  hypothetical protein  71.93 
 
 		 268 aa  346  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435514  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0550  hypothetical protein  72.77 
 
 		 253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0806  hypothetical protein  71.05 
 
 		 256 aa  339  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2122  hypothetical protein  70.61 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1573  hypothetical protein  70.61 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0615  hypothetical protein  70.61 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0708  hypothetical protein  70.61 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2028  hypothetical protein  70.61 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2210  hypothetical protein  70.61 
 
 		 252 aa  338  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2936  hypothetical protein  67.54 
 
 		 237 aa  332  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3752  hypothetical protein  67.41 
 
 		 250 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.373464  normal  0.298029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0369  hypothetical protein  68.98 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.535424  normal  0.368582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1005  hypothetical protein  62.01 
 
 		 235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938638  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5118  hypothetical protein  63.93 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1043  hypothetical protein  64.19 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0477  hypothetical protein  63.84 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4934  hypothetical protein  60.53 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4926  hypothetical protein  62.95 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4049  hypothetical protein  59.11 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460328  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5451  hypothetical protein  64.02 
 
 		 215 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0109  hypothetical protein  63.56 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3796  hypothetical protein  61.78 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0260876  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1574  hypothetical protein  52.44 
 
 		 237 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6380  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  51.32 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0564  Protein of unknown function DUF2086  49.78 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0319  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  48.89 
 
 		 239 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1062  hypothetical protein  48.7 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0185  hypothetical protein  48.55 
 
 		 243 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5613  hypothetical protein  48.89 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195898  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4448  hypothetical protein  46.09 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3764  hypothetical protein  48.47 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4735  hypothetical protein  50.66 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4932  hypothetical protein  47.56 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06480  hypothetical protein  44.74 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12256  hypothetical protein  49.7 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3794  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0438272  normal  0.676027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0315  hypothetical protein  40.31 
 
 		 142 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.362131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>