51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4735 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4735  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3764  hypothetical protein  58.72 
 
 
234 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4932  hypothetical protein  55.8 
 
 
225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2433  hypothetical protein  50.66 
 
 
246 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1573  hypothetical protein  50.22 
 
 
260 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0708  hypothetical protein  50.22 
 
 
260 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2028  hypothetical protein  50.22 
 
 
260 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2122  hypothetical protein  50.22 
 
 
260 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2210  hypothetical protein  50.22 
 
 
252 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0615  hypothetical protein  50.22 
 
 
260 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2839  hypothetical protein  49.78 
 
 
246 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2567  hypothetical protein  47.21 
 
 
250 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2935  hypothetical protein  47.6 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0806  hypothetical protein  48.48 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4976  hypothetical protein  47.23 
 
 
253 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6605  hypothetical protein  47.64 
 
 
267 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202488  normal  0.0603228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3431  hypothetical protein  48.48 
 
 
290 aa  191  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0788325  normal  0.331854 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5292  hypothetical protein  47.23 
 
 
253 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3075  hypothetical protein  47.23 
 
 
253 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3752  hypothetical protein  48.66 
 
 
250 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.373464  normal  0.298029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4874  hypothetical protein  44.64 
 
 
242 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0356  hypothetical protein  45.96 
 
 
287 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605747  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2936  hypothetical protein  46.15 
 
 
237 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58625  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4653  hypothetical protein  45.78 
 
 
263 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000611721  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2586  hypothetical protein  46.67 
 
 
270 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195535  normal  0.261954 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5181  hypothetical protein  47.16 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4641  hypothetical protein  45.45 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435514  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0550  hypothetical protein  45.78 
 
 
253 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1043  hypothetical protein  47.11 
 
 
234 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0477  hypothetical protein  42.74 
 
 
240 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4934  hypothetical protein  42.67 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1005  hypothetical protein  42.04 
 
 
235 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938638  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0564  Protein of unknown function DUF2086  38.26 
 
 
231 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0369  hypothetical protein  43.98 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.535424  normal  0.368582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3794  hypothetical protein  45.26 
 
 
237 aa  164  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0438272  normal  0.676027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4049  hypothetical protein  41.78 
 
 
228 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460328  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5118  hypothetical protein  42.92 
 
 
248 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5451  hypothetical protein  43.26 
 
 
215 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0109  hypothetical protein  42.37 
 
 
237 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4926  hypothetical protein  41.3 
 
 
240 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6380  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.47 
 
 
237 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3796  hypothetical protein  40.62 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0260876  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1574  hypothetical protein  32.59 
 
 
237 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0319  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.53 
 
 
239 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1062  hypothetical protein  34.78 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5613  hypothetical protein  36.17 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195898  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0185  hypothetical protein  35.71 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4448  hypothetical protein  36.89 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06480  hypothetical protein  34.2 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12256  hypothetical protein  38.06 
 
 
233 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290448  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0315  hypothetical protein  26.72 
 
 
142 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.362131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>