51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4653 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4653  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000611721  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5181  hypothetical protein  96.76 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0356  hypothetical protein  86.51 
 
 		 287 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5292  hypothetical protein  86.45 
 
 		 253 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3075  hypothetical protein  86.45 
 
 		 253 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4976  hypothetical protein  85.66 
 
 		 253 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3431  hypothetical protein  79.31 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0788325  normal  0.331854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6605  hypothetical protein  76.96 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202488  normal  0.0603228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4641  hypothetical protein  73.44 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435514  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2586  hypothetical protein  70.56 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195535  normal  0.261954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2567  hypothetical protein  75 
 
 		 250 aa  358  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0550  hypothetical protein  73.8 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0806  hypothetical protein  72.41 
 
 		 256 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2839  hypothetical protein  74.12 
 
 		 246 aa  354  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2433  hypothetical protein  72.37 
 
 		 246 aa  349  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2935  hypothetical protein  72.93 
 
 		 247 aa  349  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1573  hypothetical protein  72.37 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0708  hypothetical protein  72.37 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0615  hypothetical protein  72.37 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2122  hypothetical protein  72.37 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2028  hypothetical protein  72.37 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2210  hypothetical protein  72.37 
 
 		 252 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4874  hypothetical protein  70.48 
 
 		 242 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3752  hypothetical protein  69.96 
 
 		 250 aa  342  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.373464  normal  0.298029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1043  hypothetical protein  70.18 
 
 		 234 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2936  hypothetical protein  65.79 
 
 		 237 aa  323  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0477  hypothetical protein  63.95 
 
 		 240 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0369  hypothetical protein  67.95 
 
 		 241 aa  321  7e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.535424  normal  0.368582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1005  hypothetical protein  65.35 
 
 		 235 aa  321  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938638  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5118  hypothetical protein  68.56 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4926  hypothetical protein  64.89 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4934  hypothetical protein  59.66 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4049  hypothetical protein  63.27 
 
 		 228 aa  294  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460328  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5451  hypothetical protein  65.57 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0109  hypothetical protein  65.5 
 
 		 237 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3796  hypothetical protein  63.84 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0260876  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6380  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  48.29 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0564  Protein of unknown function DUF2086  50.88 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1574  hypothetical protein  48.07 
 
 		 237 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0319  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  49.78 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1062  hypothetical protein  49.56 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4448  hypothetical protein  50.44 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5613  hypothetical protein  50.42 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195898  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0185  hypothetical protein  49.14 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06480  hypothetical protein  46.09 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3764  hypothetical protein  48 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4932  hypothetical protein  45.13 
 
 		 225 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4735  hypothetical protein  45.78 
 
 		 238 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12256  hypothetical protein  52.69 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3794  hypothetical protein  39.91 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0438272  normal  0.676027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0315  hypothetical protein  43.31 
 
 		 142 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.362131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>