51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06480  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5613  hypothetical protein  66.8 
 
 
250 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195898  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0185  hypothetical protein  66.24 
 
 
243 aa  324  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4448  hypothetical protein  61.78 
 
 
232 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12256  hypothetical protein  72.62 
 
 
233 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290448  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1574  hypothetical protein  45.41 
 
 
237 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0564  Protein of unknown function DUF2086  45.85 
 
 
231 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4976  hypothetical protein  45.23 
 
 
253 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3075  hypothetical protein  45.23 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5292  hypothetical protein  45.23 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0356  hypothetical protein  44.4 
 
 
287 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605747  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0806  hypothetical protein  45.69 
 
 
256 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2567  hypothetical protein  46.05 
 
 
250 aa  217  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4049  hypothetical protein  47.56 
 
 
228 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460328  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4653  hypothetical protein  46.09 
 
 
263 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000611721  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5181  hypothetical protein  44.81 
 
 
247 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0477  hypothetical protein  45.06 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1005  hypothetical protein  46.88 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938638  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6380  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.72 
 
 
237 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6605  hypothetical protein  46.12 
 
 
267 aa  215  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202488  normal  0.0603228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3431  hypothetical protein  47.19 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0788325  normal  0.331854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4641  hypothetical protein  45.65 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435514  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4874  hypothetical protein  44.17 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2586  hypothetical protein  45.45 
 
 
270 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195535  normal  0.261954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0550  hypothetical protein  45.85 
 
 
253 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2935  hypothetical protein  45.61 
 
 
247 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3752  hypothetical protein  44.78 
 
 
250 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.373464  normal  0.298029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2936  hypothetical protein  44.4 
 
 
237 aa  208  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58625  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4926  hypothetical protein  45.09 
 
 
240 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0615  hypothetical protein  41.31 
 
 
260 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1573  hypothetical protein  43.86 
 
 
260 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0708  hypothetical protein  43.86 
 
 
260 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2122  hypothetical protein  41.31 
 
 
260 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2210  hypothetical protein  43.86 
 
 
252 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2028  hypothetical protein  43.86 
 
 
260 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2433  hypothetical protein  44.74 
 
 
246 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1043  hypothetical protein  44.98 
 
 
234 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2839  hypothetical protein  45.09 
 
 
246 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0319  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.74 
 
 
239 aa  202  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1062  hypothetical protein  39.73 
 
 
233 aa  195  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4934  hypothetical protein  38.33 
 
 
252 aa  194  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5118  hypothetical protein  43.56 
 
 
248 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0369  hypothetical protein  42.15 
 
 
241 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.535424  normal  0.368582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0109  hypothetical protein  44.16 
 
 
237 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3796  hypothetical protein  40.62 
 
 
327 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0260876  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5451  hypothetical protein  43.06 
 
 
215 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4932  hypothetical protein  35.71 
 
 
225 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3764  hypothetical protein  34.65 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4735  hypothetical protein  34.2 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0315  hypothetical protein  34.65 
 
 
142 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3794  hypothetical protein  32.02 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0438272  normal  0.676027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>