19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1180 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  98.85 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  84.48 
 
 		 170 aa  275  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  63.8 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  62.09 
 
 		 157 aa  180  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  44.38 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  40 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  42.67 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  40.94 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  39.16 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  43.71 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  39.86 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  39.87 
 
 		 167 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  35.98 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  35.98 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  32.72 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3762  hypothetical protein  36.88 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  32.87 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  41.18 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>