18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2980 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  66.46 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  53.8 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  52.27 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  57.33 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  57.33 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  56.96 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  50.68 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  50.97 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  46.39 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  45.07 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  46.21 
 
 		 157 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  40.8 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  44.37 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  44.37 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  42.38 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  31.51 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  31.65 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>