17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5001 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  56.73 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  55.21 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  55.21 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  49.08 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  48.45 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  44.16 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  43.9 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  41.67 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  42.51 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  38.65 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  38.26 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  38.78 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  37.91 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  37.91 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  37.2 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  27.78 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>