19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2075 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  100 
 
 		 171 aa  342  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  52.74 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  46.39 
 
 		 180 aa  124  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  44.79 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  47.14 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  44.3 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  46.1 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  47.65 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  43.09 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  40.13 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  42.6 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  44.83 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  44.83 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  40.36 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  44.52 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  38.99 
 
 		 179 aa  94  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  43.17 
 
 		 161 aa  90.9  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0627  hypothetical protein  26.5 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0467  hypothetical protein  26.5 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>