17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1443 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  100 
 
 		 172 aa  346  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  68.07 
 
 		 167 aa  215  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  67.47 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  57.65 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  58.97 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  52.63 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  54.49 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  51.57 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  49.04 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  48.32 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  41.72 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  40.79 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  43.75 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  36.47 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  38.82 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  38.82 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  31.33 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>