20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1259 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  82.18 
 
 		 174 aa  260  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  81.03 
 
 		 174 aa  257  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  67.35 
 
 		 157 aa  193  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  62.35 
 
 		 188 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  45.58 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  41.25 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  44.52 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  40 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  40.96 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  40.8 
 
 		 180 aa  98.2  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  38.26 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  35.84 
 
 		 167 aa  85.1  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  35.84 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  39.01 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  32.92 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  43.21 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3762  hypothetical protein  30.22 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0467  hypothetical protein  32.31 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>