20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2061 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  71.52 
 
 		 188 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  67.35 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  61.33 
 
 		 174 aa  173  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  61.33 
 
 		 174 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  45.33 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  46.71 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  41.72 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  43.67 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  45.45 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  40.54 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  43.92 
 
 		 171 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  41.78 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  39.35 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  39.35 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  36.42 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  39.02 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  40.45 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3762  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2448  hypothetical protein  36.56 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000154808  normal  0.769134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>