15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3762 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3762  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  39.57 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  40.51 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  38.36 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  38.36 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  31.36 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  34.23 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  30.72 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  30.82 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  27.44 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2448  hypothetical protein  32.74 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000154808  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  30.41 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  33.09 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  36.25 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>