19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2056 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  71.52 
 
 		 157 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  69.18 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  66.89 
 
 		 174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  66.89 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  40.57 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  44.03 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  49.59 
 
 		 168 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  38.37 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  41.03 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  42.51 
 
 		 171 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  38.36 
 
 		 167 aa  87.8  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  39.73 
 
 		 161 aa  84.7  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  37.57 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  37.57 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  36.25 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3762  hypothetical protein  34.29 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  33.8 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  35.17 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>