40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0062 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  772    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  77.93 
 
 		 376 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  72.82 
 
 		 379 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  25.88 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  25.16 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  28.83 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  26.95 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  31.46 
 
 		 259 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  31.46 
 
 		 306 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  27.5 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  32.71 
 
 		 235 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  32.73 
 
 		 247 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  33.85 
 
 		 220 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  32.32 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  28.23 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  28.27 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  28 
 
 		 360 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  32.28 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  33.16 
 
 		 262 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  27.72 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  30.77 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  26.23 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  24.59 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  22.98 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  23.88 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  24.38 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  24.14 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  24.66 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  25.9 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  22.71 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  23.88 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  23.91 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  23.83 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  22.78 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  22.77 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0663  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0494  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1381  hypothetical protein  43.64 
 
 		 130 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0859  hypothetical protein  43.64 
 
 		 130 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>