28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3864 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  776    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  31.88 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  30.52 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  26.82 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  27.31 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  25.91 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  25.91 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  25.91 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  20.94 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  22.78 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  25.17 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  23.69 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  24.57 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  22.8 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  31.78 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  32.43 
 
 		 235 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  29.92 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  34.02 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  22.61 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  32.09 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  30.3 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3237  hypothetical protein  26.06 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  32.29 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  25.23 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  21.3 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  21.3 
 
 		 280 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2611  hypothetical protein  31.48 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0183477  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  32.32 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>