35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2368 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  92.88 
 
 		 377 aa  711    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  87.2 
 
 		 375 aa  668    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  766    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  79.14 
 
 		 385 aa  617  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  75.61 
 
 		 376 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  27.8 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  26.95 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  23.82 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  23.41 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  23.88 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  23.61 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  23.81 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  24.35 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  28.98 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  24.61 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  25.81 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  27.8 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  28.09 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  27.59 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  25.58 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  24.83 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  27.95 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  35.11 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  35.11 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  35.11 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  26.92 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  24.1 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3618  hypothetical protein  22.99 
 
 		 297 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00152122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2114  hypothetical protein  22.99 
 
 		 292 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  23.93 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  30.3 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  24.22 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  27.43 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  23.11 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>