40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3774 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  84.69 
 
 
322 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  57.76 
 
 
322 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  59.14 
 
 
280 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  54.2 
 
 
305 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  28.01 
 
 
379 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  29.18 
 
 
360 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  25.16 
 
 
376 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  25.32 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  27.16 
 
 
309 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  26.76 
 
 
358 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  26.11 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  27.84 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  26.47 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  27.1 
 
 
343 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  28.46 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  31.58 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  25.96 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  31.58 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  24.68 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  31.05 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  31.52 
 
 
220 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  26.09 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  26.95 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  23.03 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  26.57 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  24.6 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  28.12 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  23.81 
 
 
373 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  24.25 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  23.1 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  21.65 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  24.16 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  23.53 
 
 
308 aa  56.2  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  25.99 
 
 
368 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  25.17 
 
 
372 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0841  hypothetical protein  24.12 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1215  hypothetical protein  21.5 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0038  hypothetical protein  23.28 
 
 
338 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>