36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4614 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  75.1 
 
 
305 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  59.14 
 
 
322 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  57.04 
 
 
322 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  32.17 
 
 
379 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  29.04 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  27.37 
 
 
376 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  29.52 
 
 
343 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  29.33 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  29.05 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  29.09 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  30 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  28.7 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  27.14 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  28.31 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  27.37 
 
 
362 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  26.18 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  28.57 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  27.73 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  27.92 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  28.49 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  28.16 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  26.94 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  26.41 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  30.65 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  26.37 
 
 
358 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  29.74 
 
 
357 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  26.04 
 
 
377 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  28.76 
 
 
376 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  24.78 
 
 
309 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  25.58 
 
 
373 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  26.43 
 
 
375 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  22.75 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  27.08 
 
 
385 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  21.3 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>