36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3749 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  76.25 
 
 
305 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  57.76 
 
 
322 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  55.94 
 
 
322 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  30.19 
 
 
379 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  27.62 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  26.95 
 
 
376 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  29.28 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  28.57 
 
 
358 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  27.42 
 
 
309 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  25.32 
 
 
343 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  26.58 
 
 
360 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  29.52 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  29.52 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  28.7 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  27.65 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  28.05 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  25.49 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  27.98 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  27.92 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  27.33 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  26.55 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  28.49 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  30.65 
 
 
211 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  27.08 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  24.67 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  25.84 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  25.86 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  24.35 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  25.52 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  23.75 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  25.48 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  26.77 
 
 
385 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  21.3 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>