42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0060 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  785    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  72.82 
 
 
376 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  70.98 
 
 
376 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  27.65 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  28.01 
 
 
322 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  30.19 
 
 
322 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  29.94 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  35.89 
 
 
235 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  33.8 
 
 
259 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  33.8 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  32.17 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  36.46 
 
 
220 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  35.64 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  34.09 
 
 
343 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  29.18 
 
 
309 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  28.33 
 
 
358 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  29.45 
 
 
262 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  28.05 
 
 
360 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  30.25 
 
 
313 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  29.34 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  26.64 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  30.1 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  30.95 
 
 
211 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  29.43 
 
 
358 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  27.59 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  26.57 
 
 
305 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  26.86 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  24.05 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  23.67 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  23.41 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  25.46 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  22.3 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  23.31 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  23.59 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  23.93 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  20.94 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0663  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0494  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1381  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0859  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0841  hypothetical protein  23.08 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0038  hypothetical protein  21.33 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>