46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02057 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  93.59 
 
 
235 aa  454  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  97.27 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  75.45 
 
 
306 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  77.83 
 
 
259 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  77.83 
 
 
343 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  76.53 
 
 
343 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1381  hypothetical protein  76.42 
 
 
130 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0859  hypothetical protein  76.42 
 
 
130 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0494  hypothetical protein  76.29 
 
 
121 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0663  hypothetical protein  76.29 
 
 
121 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  39.9 
 
 
211 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  37.2 
 
 
262 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  38.16 
 
 
309 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  37.86 
 
 
313 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  35.64 
 
 
379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  33.64 
 
 
376 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  32.73 
 
 
376 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  35.11 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  30.2 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  31.02 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  28.64 
 
 
357 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  28.7 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  28.7 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  31.25 
 
 
360 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  30.29 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  28.97 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  31.25 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  31.58 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  27.32 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  32.88 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  34.4 
 
 
308 aa  62.4  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  27.92 
 
 
376 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  37.11 
 
 
309 aa  58.9  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  27.59 
 
 
373 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  27.59 
 
 
377 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  27.01 
 
 
385 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  27.68 
 
 
375 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  24.77 
 
 
368 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  22.4 
 
 
317 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3852  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  31.78 
 
 
372 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3853  hypothetical protein  31.68 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0647  hypothetical protein  23.22 
 
 
391 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  normal  0.0829547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0841  hypothetical protein  29.84 
 
 
338 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0646  hypothetical protein  22.83 
 
 
377 aa  41.6  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436257  normal  0.112784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>