41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2251 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  656    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  23.21 
 
 
309 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  26.3 
 
 
308 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  26.46 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  25.96 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  24.92 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  27.21 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  24.5 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  26.55 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  26.41 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  26.64 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  22.3 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  25.57 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  28.74 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  26.26 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  26.26 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  26.26 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  27.31 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  22.9 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  25.62 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  25.45 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  28.95 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  25.5 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  24.61 
 
 
373 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  27.07 
 
 
211 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  25.87 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  29.08 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  25.99 
 
 
375 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  23.83 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  24.66 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0647  hypothetical protein  24.12 
 
 
391 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  normal  0.0829547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  23.49 
 
 
358 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  24.74 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0646  hypothetical protein  23.62 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436257  normal  0.112784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  22.54 
 
 
376 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  22.7 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  22.52 
 
 
368 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  22.4 
 
 
247 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  23.08 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2202  hypothetical protein  24.88 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.345724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2855  hypothetical protein  29.69 
 
 
272 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337244  normal  0.112469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>