42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2758 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  636    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  32.25 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  33.01 
 
 
313 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  32.14 
 
 
321 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  32.23 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  36.32 
 
 
211 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  28.37 
 
 
357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  31.91 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  32.23 
 
 
306 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  27.76 
 
 
358 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  29.78 
 
 
343 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  35.68 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  29.34 
 
 
379 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  26.23 
 
 
360 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  27.48 
 
 
376 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  26.11 
 
 
322 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  30.2 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  25.24 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  32.61 
 
 
235 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  26.64 
 
 
360 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  25.42 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  25.77 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  32.4 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  25.49 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  26.23 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  26.18 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  26.64 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  28.95 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  27.8 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  26.56 
 
 
377 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0647  hypothetical protein  26.48 
 
 
391 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  normal  0.0829547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0646  hypothetical protein  26.67 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436257  normal  0.112784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  24.73 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  27.98 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  28 
 
 
375 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  26.42 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1215  hypothetical protein  23.83 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1217  hypothetical protein  23.03 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3853  hypothetical protein  21.39 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3852  hypothetical protein  21.62 
 
 
306 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  23.91 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0841  hypothetical protein  24.62 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>