35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2277 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  737    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  71.95 
 
 
358 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  28.37 
 
 
308 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  30.77 
 
 
313 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  30.66 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  29.17 
 
 
262 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  30.37 
 
 
321 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  26.35 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  33.85 
 
 
211 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  26.12 
 
 
306 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  27.92 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  29.05 
 
 
259 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  28.64 
 
 
247 aa  86.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  27.59 
 
 
379 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  28.21 
 
 
235 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  24.75 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  27.34 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  27.62 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  26.62 
 
 
358 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  25.54 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  26.1 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  26.57 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  25.95 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  22.71 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  25.52 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  29.74 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  24.66 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  25.63 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  24.43 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  24.15 
 
 
305 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  25.13 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  27.23 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1222  hypothetical protein  22.71 
 
 
315 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  25 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  23.87 
 
 
385 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>