32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2279 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2279  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  744    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0760878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  71.95 
 
 
357 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3917  hypothetical protein  32.35 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.861601  normal  0.472935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  30.99 
 
 
309 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  27.76 
 
 
308 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  31.7 
 
 
262 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3918  hypothetical protein  33.66 
 
 
211 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7019  hypothetical protein  28.67 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280958  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  26.49 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  26.49 
 
 
343 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  29.43 
 
 
379 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  25.84 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  26.25 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  28.8 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  25.46 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  26.71 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  27.32 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  25.56 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  26.7 
 
 
235 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  26.52 
 
 
220 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  23.86 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  25.17 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  26.95 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  27.08 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  26.37 
 
 
280 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  23.88 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  23.49 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  24.54 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  24.88 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  25.62 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  23.93 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  22.22 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>