26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3876 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  82.45 
 
 		 288 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  86.22 
 
 		 264 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  85.19 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  66.67 
 
 		 257 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  64.5 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  61.64 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  61.64 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  60.83 
 
 		 283 aa  255  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  59.91 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  59.91 
 
 		 294 aa  252  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  44.63 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  46.64 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  44.49 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  43.62 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  44.03 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  45.9 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  44.39 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  48.62 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  45.21 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  37.99 
 
 		 185 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  35.48 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  39.35 
 
 		 178 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  39.38 
 
 		 182 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  41.88 
 
 		 175 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  31.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>