29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3034 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  52.05 
 
 
257 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  47.46 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  48.25 
 
 
288 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  46.43 
 
 
257 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  49.34 
 
 
264 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  45.09 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  43.21 
 
 
257 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  49.09 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  50 
 
 
283 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  49.07 
 
 
281 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  49.07 
 
 
294 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  45.33 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  47.6 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  48.87 
 
 
264 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.85 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  41.63 
 
 
252 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  46.89 
 
 
259 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  47.89 
 
 
263 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  48.05 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  47.57 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  45.75 
 
 
178 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  44.51 
 
 
196 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  43.51 
 
 
185 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  44.81 
 
 
175 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  27.87 
 
 
152 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1668  hypothetical protein  38.78 
 
 
132 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.356624  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0443  hypothetical protein  45.28 
 
 
125 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.128989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1641  hypothetical protein  38.78 
 
 
132 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>