28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0563 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  63.24 
 
 
257 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  60.42 
 
 
257 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  59.17 
 
 
257 aa  306  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  74.32 
 
 
228 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  57.85 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  48.84 
 
 
257 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  46.22 
 
 
264 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  47.89 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  47 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  44.4 
 
 
294 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  44.4 
 
 
281 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  46.4 
 
 
283 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  46.51 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  50 
 
 
283 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  46.33 
 
 
257 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  43.58 
 
 
244 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  42.06 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  53.59 
 
 
178 aa  162  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  49.54 
 
 
264 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.62 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  50 
 
 
196 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  42.41 
 
 
185 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  43.83 
 
 
182 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  43.51 
 
 
175 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  28.99 
 
 
152 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1641  hypothetical protein  46.94 
 
 
132 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1668  hypothetical protein  44.9 
 
 
132 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.356624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>