28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0944 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  57.53 
 
 		 257 aa  268  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  74.4 
 
 		 263 aa  263  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  58.33 
 
 		 257 aa  261  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  56.48 
 
 		 257 aa  256  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  58.73 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  50.62 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  48.94 
 
 		 257 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  48.73 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  47.57 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  41.57 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  48.41 
 
 		 175 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  44.68 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  45.81 
 
 		 182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  44.62 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  42.55 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  42.93 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  42.78 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  43.62 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  39.09 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  42.47 
 
 		 288 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.93 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  44.77 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  37.77 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  45.35 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  28.37 
 
 		 152 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1668  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.356624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1641  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>