27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0426 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  87.74 
 
 
264 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  71.73 
 
 
283 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  69.14 
 
 
281 aa  332  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  69.14 
 
 
294 aa  332  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  60.19 
 
 
288 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  55.84 
 
 
257 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  54.88 
 
 
244 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  61.01 
 
 
283 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  59.91 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  60.55 
 
 
264 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  44.53 
 
 
252 aa  224  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  49.34 
 
 
259 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  42.06 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  43.7 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  41.1 
 
 
257 aa  165  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  39.55 
 
 
257 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  41.01 
 
 
257 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  47 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  42.78 
 
 
228 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  36.08 
 
 
185 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  41.67 
 
 
178 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  35.83 
 
 
196 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  34.07 
 
 
182 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  39.87 
 
 
175 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  30.71 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1641  hypothetical protein  27.94 
 
 
132 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>