26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0325 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  373  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  68.79 
 
 
185 aa  254  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  73.01 
 
 
175 aa  248  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  55.9 
 
 
178 aa  194  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  52.66 
 
 
196 aa  193  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  49.7 
 
 
257 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  48.05 
 
 
259 aa  147  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  40.96 
 
 
257 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  40.43 
 
 
257 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  40.43 
 
 
257 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  45.81 
 
 
228 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  43.83 
 
 
263 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  42.86 
 
 
259 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  40 
 
 
257 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  34.83 
 
 
244 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  38.71 
 
 
288 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  38.31 
 
 
283 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  37.97 
 
 
264 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  39.38 
 
 
257 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  38.31 
 
 
281 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  38.31 
 
 
294 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  36.94 
 
 
264 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  37.18 
 
 
283 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  37.82 
 
 
264 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  32.43 
 
 
252 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  29.41 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>