26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2180 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  90.73 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  82.14 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  86.22 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  66.23 
 
 		 257 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  61.63 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  59.46 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  61.47 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  59.73 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  59.28 
 
 		 294 aa  254  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  59.28 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  42.86 
 
 		 252 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  49.77 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  45.04 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  46.73 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  46.73 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  46.5 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  42.53 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  49.54 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  44.68 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  36.9 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  36.87 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  37.82 
 
 		 182 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  38.75 
 
 		 175 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  30.5 
 
 		 152 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>