27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0198 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  74.68 
 
 		 178 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  54.19 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  52.66 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  53.99 
 
 		 175 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  50.63 
 
 		 257 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  51.3 
 
 		 257 aa  160  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  51.55 
 
 		 263 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  51.27 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  48.73 
 
 		 228 aa  154  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  44.65 
 
 		 257 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  46.54 
 
 		 257 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  44.51 
 
 		 259 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  42.04 
 
 		 264 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  41.03 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  38.06 
 
 		 257 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  41.03 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  41.18 
 
 		 283 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  38.06 
 
 		 257 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  39.49 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  38.06 
 
 		 264 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  34.72 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  37.01 
 
 		 283 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  37.42 
 
 		 288 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  32.09 
 
 		 244 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1668  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.356624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1641  hypothetical protein  37.04 
 
 		 132 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>