27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1181 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  524  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  77.52 
 
 
257 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  67.44 
 
 
257 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  66.28 
 
 
257 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  64.52 
 
 
263 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  58.13 
 
 
228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  46.26 
 
 
264 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  47.89 
 
 
264 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  49.29 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  45.21 
 
 
257 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  46.89 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  46.19 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  45.45 
 
 
257 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  50.71 
 
 
283 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  44.76 
 
 
281 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  44.76 
 
 
294 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  41.9 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  50.95 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.82 
 
 
257 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  51.27 
 
 
196 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  48.45 
 
 
178 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  39.07 
 
 
252 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  37.82 
 
 
185 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  42.86 
 
 
182 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  43.42 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  31.01 
 
 
152 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0443  hypothetical protein  30.71 
 
 
125 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.128989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>