26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4427 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  91.7 
 
 
281 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  91.7 
 
 
294 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  71.37 
 
 
264 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  72 
 
 
264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  59.45 
 
 
288 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  57.34 
 
 
257 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  55.6 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  58.9 
 
 
283 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  57.2 
 
 
264 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  60.83 
 
 
257 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  45.38 
 
 
252 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  50 
 
 
259 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  41.3 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  44.91 
 
 
257 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  43.03 
 
 
259 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  39.82 
 
 
257 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  46.4 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  44.68 
 
 
228 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  39.87 
 
 
185 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  37.3 
 
 
196 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  40.13 
 
 
178 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  41.18 
 
 
175 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  34.83 
 
 
182 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  28.29 
 
 
152 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>