26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1669 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  89.27 
 
 
264 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  67.92 
 
 
281 aa  328  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  67.92 
 
 
294 aa  328  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  69.62 
 
 
283 aa  325  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  57.32 
 
 
244 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  56.71 
 
 
257 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  59.72 
 
 
288 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  61.01 
 
 
283 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  59.91 
 
 
257 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  61.47 
 
 
264 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  44.31 
 
 
252 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  42.75 
 
 
257 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  43.41 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  49.09 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  37.59 
 
 
257 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  37.22 
 
 
257 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  43.26 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  46.22 
 
 
263 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  43.85 
 
 
228 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  38.99 
 
 
185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  37.97 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  42.31 
 
 
178 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  41.14 
 
 
175 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  34.97 
 
 
182 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>