29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2874 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  51.77 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  45.16 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  45.16 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  43.72 
 
 
257 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  52.17 
 
 
178 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  50.29 
 
 
182 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  41.23 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  42.4 
 
 
259 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  44.13 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  46.28 
 
 
196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  42.53 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  42.73 
 
 
264 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  47.73 
 
 
185 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  45.7 
 
 
228 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  43.52 
 
 
294 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  44.91 
 
 
283 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  43.52 
 
 
281 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  49.07 
 
 
263 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  40.91 
 
 
264 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  40.37 
 
 
252 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  42.08 
 
 
283 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  44.39 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  42.53 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  39.66 
 
 
152 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0443  hypothetical protein  44.07 
 
 
125 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.128989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1668  hypothetical protein  47.62 
 
 
132 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.356624  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1641  hypothetical protein  47.62 
 
 
132 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>