14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0846 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  69.4 
 
 
134 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  70.9 
 
 
133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  55.74 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  54.92 
 
 
155 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  58.78 
 
 
151 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  52.46 
 
 
154 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  42.28 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  43.2 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  41.22 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  35.16 
 
 
279 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  33.85 
 
 
269 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.330686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  31.15 
 
 
289 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>