14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0682 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  84.33 
 
 
134 aa  229  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  92.54 
 
 
134 aa  224  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  47.15 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  44.72 
 
 
155 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  44.12 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  44.72 
 
 
154 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  48.78 
 
 
151 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  45.16 
 
 
133 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  41.04 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  41.46 
 
 
133 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  34.65 
 
 
289 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  37.1 
 
 
269 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.330686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  36.67 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>